姓名：马园园

职称：副教授

学历：博士研究生

研究方向：微生物多组学，单细胞多组学，机器学习。

个人简介：

马园园，男，1983.11，出生于河南省许昌市，博士研究生学历，副教授，2018年6月博士毕业于华中师范大学管理科学与工程专业，2020.10—2021.11于香港中文大学开展单细胞多组学研究。承担《机器学习》、《python编程实践》、《计算机专业英语》等课程的教学工作。主要从事生物信息学、微生物多组学、单细胞大数据等方向的研究工作。以第一作者或通讯作者在微生物组学数据挖掘和单细胞多组学数据挖掘等方面公开发表学术论文20余篇，其中10篇SCI收录论文，主编3本著作；主持1项教育部人文社科项目、1项省级项目；积极参与学术服务，担任了IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (IEEE BIBM，CCF B类会议)程序委员会委员，担任了本领域多个国际期刊的编委、审稿等工作。代表性成果简述如下：

一、项目类：

1.主持，教育部人文社科项目，基于多视角学习的甲骨卜辞语义网络融合模型与应用研究，项目编号20YJC740042；

2.主持，河南省科技攻关项目，基于多组学时间序列数据的微生物与人类疾病关系研究，基金编号202102310561；

3.主持，河南省教育厅自然科学基金项目，基于多组学数据的微生物动态网络模式提取与分析关键技术研究，基金编号20B520002。

二、论文类：

1. Ma Y, Liu L, Ma Y, et al. HONMF: integration analysis of multi-omics microbiome data via matrix factorization and hypergraph. Bioinformatics, 2023. (SCI)

2. Zhao Y, Ma Y*, Zhang Q. Metabolite-disease interaction prediction based on logistic matrix factorization and local neighborhood constraints. Frontiers in Psychiatry, 2023. (SCI)

3. Ma Y, Sun Z, Zeng P, et al. JSNMF enables effective and accurate integrative analysis of single-cell multiomics data. Briefings in Bioinformatics, 2022. (SCI)

4. Ma Y, Liu L, Chen Q, et al. An inductive logistic matrix factorization model for predicting drug-metabolite association with vicus regularization. Frontiers in Microbiology, 2021. (SCI)

5. Ma Y, Zhao J, Ma Y. MHSNMF: multi-view hessian regularization based symmetric nonnegative matrix factorization for microbiome data analysis. BMC Bioinformatics, 2020. (SCI)

6. Ma Y, Liu G, Ma Y, et al. Integrative analysis for identifying co-modules of microbe-disease data by matrix tri-factorization with phylogenetic information. Frontiers in Genetics, 2020. (SCI)

7. Ma Y, Hu X, He T, et al. Clustering and integrating of heterogeneous microbiome data by joint symmetric nonnegative matrix factorization with laplacian regularization. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2017. (SCI)

8. Ma Y, Hu X, He T, et al. Hessian regularization based symmetric nonnegative matrix factorization for clustering gene expression and microbiome data. Methods, 2016. (SCI)

三、著作类：

1. 马园园. 基于矩阵分解的信息融合方法与应用. 科学技术文献出版社, 2019年7月出版；

2. 马园园. 基于多视角学习的甲骨卜辞语义网络融合方法与应用研究. 科学技术文献出版社，2023年9月出版。

四、荣誉类：

1. 2022年获得河南省教育厅优秀科技论文二等奖（第一）；

2. 2019年获得安阳市自然科学论文一等奖（第一）。